کلیسای چوپان در شهر جلفای آذربایجان شرقی واقه شده است. کلیسای چوپان در سال ۱۵۱۸ میلادی برای چوپانان و عامه مردم که دسترسی به کلیسای منطقه دره شام را نداشتند ساخته شده است تا بتوانند فیوضات دینی خود را به جا آورند. این کلیسا در ۷ کیلومتری غرب شهر جلفا در نوار ساحلی رود ارس قرار گرفته است. ساختمان کلیسا از خارج مربعی شکل به ابعاد ۵.۷ در ۷.۷ متر و از داخل صلیبی شکل بوده و کلیسای کوچک محسوب می گردد. ورودی اصلی در قسمت غربی بنا قرار داشته و محراب آن در سمت شرق بنا می باشد. مصالح به کار رفته در ساختمان آن سنگ و ملات است و سطح دیوارهای داخلی با گچ پوشانده شده است.